NGS、甲基化检测、基因测序……这些名字听起来很高大上的检查手段,其实都是基因检测。目前,比较流行的是大家较为熟悉的NGS。
那么,NGS是什么?为什么不同的患者需要检测的项目不同?难道不是检测的项目越多越好吗?
最近,一位患者向我咨询:“医生,我3年前得了肺癌,做了手术。近期复查,显示我的肺上又长了几个小结节,穿刺结果和上次一样,还是癌……大夫让我做个NGS检测,那是什么啊?我有个病友,他说他做了肺癌9基因检测。我们不懂,为啥都是肺癌,做的检查还不一样呢?”我想,像这名患者一样不明白基因检测有什么用途的不在少数。
什么是NGS
NGS(next-generation sequencing)是一种高通量基因测序技术,又名下一代测序。它能够在相对短的时间内同时检测大量DNA片段,通过和正常基因序列比对,高效、准确地检测出样本中基因发生的改变,就像给孩子检查算术题,NGS能够一目十行,把错误检查出来。这项技术通常应用于产前诊断和恶性肿瘤的诊断及指导用药上。
简单说,NGS就是基因检测技术的一种。它的特点是可以对几十万至几百万条DNA分子同时进行序列测定。而以往的检测方法,包括一代测序技术、聚合酶链式反应(PCR)、荧光原位杂交(FISH),每次只能检测一个或几个基因,且耗时较长。
为什么要进行NGS检测
01
辅助诊断
肿瘤其实很狡猾,有时长得四不像,很难通过常规手段明确诊断,这时NGS就可以大显身手了。由于不同肿瘤有不同基因改变的特点,对于诊断不明确的肿瘤,NGS可以将肿瘤细胞具有的基因改变一次性检测出来,这样就可以在短时间内明确诊断,临床医生也能够顺利制订下一步的治疗计划。
02
寻找肿瘤用药靶点
近年来,靶向药物和免疫药物的出现改善了肿瘤的治疗效果。以往的化疗药物虽然能够杀死肿瘤细胞,但同时也会杀死人体的正常细胞,没有特异性,而靶向药物解决了这一问题。
靶向药物可以识别肿瘤细胞的特定靶点,针对性地清除肿瘤细胞,对正常细胞没有影响。打个比方,这就像我们给肿瘤细胞安装了一个GPS(全球定位系统)。靶向药物可以追踪着GPS的信号,找到肿瘤细胞,然后杀死它们。但想要使用靶向药,就要先明确是否有相应的靶点。
NGS可以将肿瘤细胞不同于正常细胞的基因改变检测出来,这就相当于找到了肿瘤里所有隐藏的GPS信号。根据这些基因改变,临床医生可以有的放矢地选择相应的靶向药物为患者进行治疗。目前,欧洲肿瘤医学学会(ESMO)推荐:晚期非鳞非小细胞肺癌、转移性乳腺癌、结直肠癌、前列腺癌、转移性胃癌、胰腺导管腺癌、晚期卵巢癌、晚期肝细胞癌和晚期胆管癌患者常规应用NGS进行检测。
03
如何选择NGS项目
NGS根据肿瘤类型及检测的基因数目不同分成了多种“套餐”,这就像我们去吃快餐,是吃汉堡可乐薯条套餐,还是盖饭紫菜汤套餐。具体选择何种套餐,需要根据我们的口味和需求来决定。现在可供选择的NGS项目包括肺癌9基因、乳腺癌21基因、实体瘤基因、神经肿瘤基因等。具体如何选择呢?
我以肺癌为例讲解一下。肺癌9基因检测是指检测非小细胞肺癌中9个最常见驱动基因是否发生突变。如果存在突变,患者就可以应用相应的靶向药物进行治疗。相较于肺癌9基因检测,更大范围的NGS检测可覆盖更多的基因靶点,从而检测出除肺癌9基因外的其他突变基因,为靶向用药指导提供更多的可能性。
既然NGS这么有用,那肯定是检测的基因越多越好了?其实也不是。比如, LuminalA/B、未发生转移的早期乳腺癌患者可进行乳腺癌21基因检测。这21个基因可用于预测乳腺癌复发风险及接受化疗的效益比。21基因检测后若被判定为高风险,患者未来复发风险更高,化疗效果更差。根据检测结果,医生在早期即可为患者做出个性化的诊疗方案,让患者有更好的预后,进一步提高未来的生存质量。
值得一提的是,经过治疗的肿瘤患者常出现耐药。针对这类患者,NGS检测可提供更好的用药指导。肿瘤发生耐药,即原有的药物不再能杀死肿瘤细胞,这时通过NGS检测,可以把肿瘤更多的突变靶点检测出来,下一步就可以尝试新的靶向药物,这也为患者的生存提供了新的希望。
NGS检测的应用潜力是巨大的,既可以辅助疾病的诊断,又为临床诊疗提供了可靠的支持与指导。尤其是对于晚期肿瘤患者来说,NGS提供了精准的靶向治疗及免疫治疗用药指导,延长了患者的生存期,提高了他们的生存质量。
文:首都医科大学宣武医院病理科 王胜男
编辑:穆薪宇 李诗尧
校对:马杨
审核:徐秉楠 陈飞